MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F plasmid p157F-NC2

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015066	CG	3	6	37	42	0 %	0 %	50 %	50 %	322690190
2	NC_015066	GCCACG	2	12	55	66	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322690190
3	NC_015066	GCG	2	6	102	107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690190
4	NC_015066	TGC	2	6	143	148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
5	NC_015066	CTG	2	6	160	165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
6	NC_015066	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690190
7	NC_015066	CGGA	2	8	234	241	25 %	0 %	50 %	25 %	322690190
8	NC_015066	GGCC	2	8	248	255	0 %	0 %	50 %	50 %	322690190
9	NC_015066	AAG	2	6	256	261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690190
10	NC_015066	GTG	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690190
11	NC_015066	CG	3	6	278	283	0 %	0 %	50 %	50 %	322690190
12	NC_015066	GGA	2	6	315	320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690190
13	NC_015066	AGGG	2	8	382	389	25 %	0 %	75 %	0 %	322690190
14	NC_015066	CAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690190
15	NC_015066	TCG	2	6	413	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
16	NC_015066	GGC	2	6	445	450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690190
17	NC_015066	AGC	2	6	464	469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690190
18	NC_015066	GGCA	2	8	529	536	25 %	0 %	50 %	25 %	322690190
19	NC_015066	GCAG	2	8	557	564	25 %	0 %	50 %	25 %	322690190
20	NC_015066	CG	3	6	651	656	0 %	0 %	50 %	50 %	322690190
21	NC_015066	CCA	2	6	719	724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690190
22	NC_015066	GCA	2	6	806	811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690190
23	NC_015066	CTG	2	6	817	822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
24	NC_015066	CGC	2	6	876	881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690190
25	NC_015066	CG	3	6	960	965	0 %	0 %	50 %	50 %	322690190
26	NC_015066	GAG	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690190
27	NC_015066	TGG	2	6	1057	1062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690190
28	NC_015066	GAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690190
29	NC_015066	GCC	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690190
30	NC_015066	ATC	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690190
31	NC_015066	GCC	2	6	1120	1125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690190
32	NC_015066	CG	3	6	1127	1132	0 %	0 %	50 %	50 %	322690190
33	NC_015066	GCT	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
34	NC_015066	ACC	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690190
35	NC_015066	CCACGA	2	12	1305	1316	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322690190
36	NC_015066	AAGCC	2	10	1390	1399	40 %	0 %	20 %	40 %	322690190
37	NC_015066	GCG	2	6	1450	1455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690190
38	NC_015066	GAGC	2	8	1515	1522	25 %	0 %	50 %	25 %	322690190
39	NC_015066	GAG	2	6	1552	1557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690190
40	NC_015066	GC	3	6	1605	1610	0 %	0 %	50 %	50 %	322690190
41	NC_015066	CAG	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690190
42	NC_015066	ATG	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690191
43	NC_015066	GC	3	6	1740	1745	0 %	0 %	50 %	50 %	322690191
44	NC_015066	CG	3	6	1801	1806	0 %	0 %	50 %	50 %	322690191
45	NC_015066	GCCGTC	2	12	1878	1889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690191
46	NC_015066	GC	3	6	2152	2157	0 %	0 %	50 %	50 %	322690191
47	NC_015066	CTGG	2	8	2223	2230	0 %	25 %	50 %	25 %	322690191
48	NC_015066	CTC	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690191
49	NC_015066	CCT	2	6	2285	2290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690191
50	NC_015066	GAT	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690191
51	NC_015066	CAG	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690191
52	NC_015066	CG	3	6	2374	2379	0 %	0 %	50 %	50 %	322690191
53	NC_015066	GCT	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690191
54	NC_015066	TTC	2	6	2422	2427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690191
55	NC_015066	CTC	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690191
56	NC_015066	CTT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690191
57	NC_015066	GTT	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690191
58	NC_015066	TTTA	3	12	2618	2629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015066	T	6	6	2814	2819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015066	GGC	2	6	2890	2895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690192
61	NC_015066	TCCG	2	8	2901	2908	0 %	25 %	25 %	50 %	322690192
62	NC_015066	GTC	3	9	2928	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690192
63	NC_015066	CCA	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690192
64	NC_015066	GGCG	2	8	3134	3141	0 %	0 %	75 %	25 %	322690192
65	NC_015066	TCG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690192
66	NC_015066	CCTC	2	8	3166	3173	0 %	25 %	0 %	75 %	322690192
67	NC_015066	CGG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690192
68	NC_015066	GCGTTC	2	12	3234	3245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690192
69	NC_015066	GCGCC	2	10	3249	3258	0 %	0 %	40 %	60 %	322690192
70	NC_015066	GTC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690192
71	NC_015066	GCCT	2	8	3289	3296	0 %	25 %	25 %	50 %	322690192
72	NC_015066	CAT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015066	GC	3	6	3459	3464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015066	CGC	2	6	3541	3546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015066	GCC	3	9	3572	3580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015066	CGC	2	6	3589	3594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.